Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYRIPQ8NFW9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms