Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PHTF2Q8N3S3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms