Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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