Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMC1Q7Z7K0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMC1Q7Z7K0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms