Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms