Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC141Q6ZP82 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC141Q6ZP82 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms