Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIGD1Q6UXZ0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms