Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITRM1Q5JRX3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms