Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDRD12Q587J7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDRD12Q587J7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms