Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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