Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DUSP28Q4G0W2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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