Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HIST3H3Q16695 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms