Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDK4Q16654 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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