Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
VPS72Q15906 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS72Q15906 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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