Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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