Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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PTPRKQ15262 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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PTPRKQ15262 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRKQ15262 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRKQ15262 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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PTPRKQ15262 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRKQ15262 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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