Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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R3HDM1Q15032 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
R3HDM1Q15032 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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