Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGA7Q13683 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGA7Q13683 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms