Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CUL3Q13618 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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CUL3Q13618 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CUL3Q13618 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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CUL3Q13618 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CUL3Q13618 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CUL3Q13618 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CUL3Q13618 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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