Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C1orf61Q13536 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms