Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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