Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGB3BPQ13352 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGB3BPQ13352 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGB3BPQ13352 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGB3BPQ13352 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGB3BPQ13352 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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ITGB3BPQ13352 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3BPQ13352 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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