Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RPA4Q13156 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms