Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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IFT88Q13099 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFT88Q13099 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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