Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms