Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ID3Q02535 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ID3Q02535 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms