Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms