Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK3Q00526 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK3Q00526 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK3Q00526 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK3Q00526 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms