Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSE1LP55060 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms