Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD4P46934 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NEDD4P46934 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms