Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID4AP29374 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARID4AP29374 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms