Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNA2P26232 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms