Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POLR2AP24928 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms