Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PTPRBP23467 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PTPRBP23467 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PTPRBP23467 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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