Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCNA2P20248 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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