Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRAP18433 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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