Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR1P18146 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR1P18146 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms