Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HLA-EP13747 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-EP13747 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms