Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN1P12814 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms