Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDK4P11802 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms