Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SFTPCP11686 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms