Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSF2P04141 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSF2P04141 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSF2P04141 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms