Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX11BO96011 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms