Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UPP2O95045 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UPP2O95045 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms