Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KDELR3O43731 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms