Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM1B2RUZ4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms