Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms