Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GMNCA6NCL1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms