Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.8 ms