Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TCAF1Q9Y4C2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TCAF1Q9Y4C2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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